Organizačné opatrenia – zahŕňajú celkové poňatie organizácie krajiny pri využívaní ochranného účinku vegetačnej pokrývky. Základom opatrení je návrh vhodného tvaru a veľkosti pozemku; v kombinácii s osevnými postupmi a pásovým striedaním plodín.
Dôležité je situovanie pozemkov dlhšou stranou v smere vrstevníc, zvolenie vhodnej veľkosti a tvaru pozemku a vymedzenie parciel vhodných na zmenu druhov pozemkov (delimitácia). Veľké zornené pôdne bloky je možné diverzifikovať pestovaním rôznych druhov plodín. Odporúča sa využitie pásového striedania plodín, zaraďovanie zatrávnených zasakovacích pásov, využitie biopásov, a pod. V prípade špecifickej potreby ochrany sa navrhuje ochranné zatrávnenie alebo zalesnenie a zatrávnenie pozdĺž vodných tokov.
Biopásy alebo tzv. neproduktívne plochy sú vhodným prostriedokom na zvýšenie diverzity poľnohospodárskej krajiny; zlepšenie odtokových pomerov, ochranu proti erózii (viď opatrenie Prírode blízky manažment neproduktívnych plôch v krajine).
Skrátenie aktívnej dĺžky svahu je jedno z protieróznych opatrení. Produkčná schopnosť pôdy sa znižuje vplyvom vodnej erózie, odplavením orničnej vrstvy z neúnosne dlhých svahov. Preto je vhodné do veľkoplošných blokov „vkladať“ vsakovacie pásy, remízky, medze, stromoradia, prípadne riešiť terasovanie svahov apod. Tieto opatrenia vytvárajú pre dažďovú vodu bariéru. Prípustná dĺžka svahu závisí od druhu pôdy, jej zrnitosti, od sklonu svahu a intenzity zrážok.
Diverzifikovanú štruktúru krajiny a obnovu jej rôznych mimoprodukčných funkcií je možné zabezpečiť aj ochranou a obnovou trvalej vegetácie – lesov a porastov drevín hlavne v horských oblastiach, ako aj lužných lesov, horských lúk, lesokrovinatých, krovinatých i trávnatých plôch; zalesňovaním sklonitých nevyužívaných svahov; podporou výsadby zelene v extraviláne, ako aj výsadbou medzí, remízok v poľnohospodárskej krajine (viď napr. opatrenia Výsadba plošných prvkov drevinnej vegetácie; Výsadba líniových prvkov vegetácie). Diverzifikovaná krajinná pokrývka s mozaikou poľnohospodárskej a lesnej pôdy je vo všeobecnosti menej náchylná na vytváranie povodňového odtoku. Uvedené opatrenia sa prednostne lokalizujú do polôh s horšie priepustným podložím alebo málo produktívnych plôch.
